1、农产品加计扣除1%的计算：纳税人购进用于生产或委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额，即对农产品深加工给予1%的加计扣除。会计分录借生产成本、应交税费，贷原材料。
2、政策依据：参考《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条规定，现在是按9%抵扣，生产的话可以加扣1%。农产品加计扣除1%计算是在生产环节，会计分录：可以抵扣的进项税额=原材料成本*1%，。2019年4月1日起，增值税税率进一步调整，农产品适用税率调整为9%。
3、农产品加计扣除1%计算是在生产环节，会计分录：可以抵扣的进项税额=原材料成本*1%。 购进农产品进项税的扣除规定是： 一般纳税人开具的增值税专用发票，购进企业可以按规定进行抵扣，即可以按照票面注明的税额抵扣； 海关进口增值税专用缴款书。
4、农产品加计扣除1%的计算方法如下：需要确定农产品的销售收入，即销售农产品所得的金额。符合条件的农产品包括：小麦、玉米、大豆、棉花、油菜籽等主要粮食和油料作物，以及鸡蛋、猪肉、牛肉、羊肉等畜禽产品。将销售收入乘以1%（即0.01），得出加计扣除的金额。
